Период нужен, чтобы понять - можете ли вы еще внести исправления в документ поступления и затем перепровести документы движения по позициям, которые были исправлены (если менялись стоимостные показатели, то может потребоваться перепроведение). Или период уже закрыт и корректировку нужно проводить иначе.
В общем случае ход действий следующий:
Сначала нужно понять что именно исправлено, и нужно ли аналогичное исправление в документе поступления.
Если в документе поступления исправлений не требуется (в СФ поменялось нечто не существенное для учета, например адрес грузополучателя и пр.). То достаточно ввести исправленный счет-фактуру на основании ЭСФ и  указать для него в табличной части документов-основания - ту же накладную. при проведении исправленного счета-фактуры исходный станет не актуальным. Исправленный будет связан с прежним документом поступления.

Если в документе поступления требуются исправления, но период еще открыт, то можно поступить так же как описано в предыдущем пункте, внести нужны поправки в приходную накладную и если стоимость товаров в результате исправления изменилась, то перепровести последующие документы списания/реализации.

Если исправить приходную накладную уже нельзя, то нужно отсторнивать прежнюю накладную. Ввести новую с верными данными и связать ее с исправленным ЭСФ.